Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Sall3Q62255 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Sall3Q62255 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Sall3Q62255 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Sall3Q62255 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Sall3Q62255 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Sall3Q62255 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Sall3Q62255 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Sall3Q62255 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Sall3Q62255 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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