Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sycp1Q62209 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sycp1Q62209 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sycp1Q62209 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sycp1Q62209 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sycp1Q62209 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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