Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms