Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms