Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms