Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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