Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms