Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms