Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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