Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms