Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms