Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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