Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms