Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Lrrc58Q3UGP9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Lrrc58Q3UGP9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Lrrc58Q3UGP9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Lrrc58Q3UGP9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Lrrc58Q3UGP9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Lrrc58Q3UGP9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Lrrc58Q3UGP9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Lrrc58Q3UGP9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Lrrc58Q3UGP9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms