Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LcorlQ3U285 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LcorlQ3U285 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms