Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms