Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms