Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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