Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms