Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2bQ0KL01 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms