Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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Ttc21bQ0HA38 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Ttc21bQ0HA38 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Ttc21bQ0HA38 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Ttc21bQ0HA38 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Ttc21bQ0HA38 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Ttc21bQ0HA38 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Ttc21bQ0HA38 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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Ttc21bQ0HA38 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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