Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms