Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms