Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms