Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms