Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms