Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad50P70388 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad50P70388 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad50P70388 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad50P70388 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad50P70388 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad50P70388 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad50P70388 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad50P70388 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad50P70388 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad50P70388 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad50P70388 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad50P70388 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad50P70388 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad50P70388 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad50P70388 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms