Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Snrpd3P62320 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms