Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf5P56477 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Irf5P56477 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Irf5P56477 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms