Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms