Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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