Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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TspoP50637 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TspoP50637 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TspoP50637 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TspoP50637 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TspoP50637 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TspoP50637 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TspoP50637 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TspoP50637 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TspoP50637 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TspoP50637 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TspoP50637 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TspoP50637 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TspoP50637 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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TspoP50637 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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TspoP50637 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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TspoP50637 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TspoP50637 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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TspoP50637 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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TspoP50637 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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TspoP50637 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TspoP50637 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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