Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ItgavP43406 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms