Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms