Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtbP41155 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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