Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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