Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms