Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou5f1P20263 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms