Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gata1P17679 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms