Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa-rs1P17533 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa-rs1P17533 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms