Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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P01787 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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P01787 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01787 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P01787 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01787 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01787 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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P01787 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01787 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01787 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01787 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01787 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01787 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01787 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01787 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P01787 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01787 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P01787 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01787 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P01787 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P01787 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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