Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01641 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01641 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01641 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01641 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01641 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01641 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms