Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Copb2O55029 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copb2O55029 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copb2O55029 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms