Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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