Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RaxO35602 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RaxO35602 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RaxO35602 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms