Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms