Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna3O35344 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms