Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Degs1O09005 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Degs1O09005 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms