Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm20939L7N243 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm20939L7N243 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm20939L7N243 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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