Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20795J3QP49 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms